九江大败之后，郑森属下三万大军被刘能设计击溃，郑森部下尽失，心知便是回到堵胤锡军中再也没有任何前途。一个失去嫡系部下的将领，等待他的只有朝廷问罪罢了。
所以，他便果断的带着陈辉和仅剩的二十多个心腹逃离了九江，然后辗转逃回了福建。
郑家发迹于海上，福建才是自己的老巢，郑森深知，自己要想重振郑家，只能回到福建，回到泉州。
然而此时的泉州，郑家的势力已经被叛军和王寅水师一扫而空。安平被攻陷，郑家这么多年积攒的财富悉数落入叛军之手。而叔父郑芝豹等家人虽然逃到了海上，却被王寅劝降施琅梁立等将，夺去了金厦，郑家海上的力量悉数落入王寅之手。
所以，即便回到了福建，郑森震惊的发现，自己想要复起也是几无可能。
王寅坐镇泉州，正在进行改编原本的郑家军，海上有着强大的明军水师威慑，哪里有人肯选择跟随郑森？
然而就在郑森绝望之时，王寅竟然奉命带着主力船队北上，前往杭州参加对叛军的围剿，便给了郑森一个千载难逢的机会。
这些时日以来，叛军的底细渐渐流传了开来，在福建，有着为数众多的被叛军破家的豪绅士族。这些人一开始还想着朝廷能给他们做主。谁知道王寅带兵收复了福州泉州，却丝毫不提归还豪绅们的家产。再联想叛军和陈越王寅之间的关系，福建各地的豪绅顿时绝望了起来。
于是，郑森便趁机派人劝说，轻易便劝动了一些人。豪绅们原本就和郑家有着千丝万缕的联系，郑家独霸福建十多年，暗地里积攒的力量依然十分强大。
郑芝龙死了，郑芝豹等一干郑家核心被抓，但是郑家乃是泉州大族，旁系子弟为数众多。而现在郑森是郑家名正言顺的继承人，故郑森露面之后，便很快得到了众多郑家子弟以及和郑家关系密切的家族的支持。
掌握了一定的力量之后，郑森突然发难，在被劝降的千户甘辉帮助下，攻下了和漳州相邻的南澳岛。之所以现在南澳发难，因为王寅虽走，却留下了一定的力量监控金厦泉州，再加上背叛郑家的施琅、梁立等将都登上高位，严密监视着郑家的势力，郑森不敢冒险在泉州一带举事。
南澳岛足足有一百多平方公里，岛上百姓数万，闻听郑森举事，满腹委屈的豪绅们纷纷来投，很快便召集了五千多军队，战船百多艘。
被任命为漳州总兵的梁立得知郑森举事，忙带着手下军队前来围剿。却在东山岛洋面，被郑森指挥船队打的大败。
梁立的手下多是郑家军出身，很多军官跟随郑芝龙当过海盗，根本不肯和郑家少主作战。临战畏缩不前，士兵不卖力，自然不是同仇敌忾的郑森手下对手。
眼看大败，梁立连忙乘船逃跑，却被郑森船只赶上，用飞爪把两船固定在了一起。一番接舷战之后，梁立手下大半投降，梁立也被生擒活捉！
南澳岛郑森大胜，潮州漳州一带的海上豪杰们纷纷来投，连同俘虏的梁立部下，郑森的兵力很快发展到了一万余人。
郑森虽斩杀梁立祭旗，带着军队攻打漳州府。漳州总兵梁立被杀，漳州境内再也没有和郑森匹敌的力量，郑森率军轻易攻入了漳州。
郑森叛乱的消息很快传到了福州，王寅北上，留在福建坐镇的最高官员是吕泰，以福建总兵的名义掌管整个福建的军队。
然而王寅带着主力北上，吕泰手中真正的嫡系军队只有一万来人，剩下便是施琅等降兵了。闻听郑森作乱攻陷漳州，吕泰不敢怠慢，派人给在延平府的副将送信，命其带着三千军队从延平府南下，从陆路攻向漳州。同时吕泰给泉州的施琅传令，命其小心戒备，防止郑森叛军从海上进攻泉州。
吕泰虽然只派出三千军队，然而这三千人都是精锐之师，陆上作战根本不惧叛军。
闻听明军从北面陆上攻来，郑森丝毫不做恋战，下令在漳州抢劫了一番，带着抢的粮食财物，乘船撤离了漳州府城，只把一座空城留给了明军。
有了抢夺的大量物质，郑森的实力扩展的很快。他原本想着回南澳岛修整一番，趁机整编一下军队，投奔他的漳州童生陈永华献策，说这个时候不该回师南澳，而是应该一鼓作气攻下金厦。